韩兆雪,吴芳,赵桃,杨凡,钱刚,余懋群.青稞B组醇溶蛋白基因5''''上游调控区的TAIL-PCR克隆及序列分析[J].麦类作物学报,2007,27(4):613 |
青稞B组醇溶蛋白基因5''''上游调控区的TAIL-PCR克隆及序列分析 |
Cloning of B-hordein Gene 5'''' Upstream Regulation Sequence in Highland Barley and Sequence Analysis |
修订日期:2007-03-20 |
DOI:10.7606/j.issn.1009-1041.2007.04.148 |
中文关键词: 青稞 B-hordein基因 上游调控序列 TAIL-PCR 序列分析 青稞 醇溶蛋白基因 上游调控区 克隆 序列分析 Gene Cloning Sequence Analysis Highland Barley 结构 突变 酸位 核苷 高度 基序 Endosperm 胚乳 存在 序列相似性 vulgare |
英文关键词: |
基金项目:科技部基础性工作项目
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国家科技支撑计划农作物种质资源项目
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中国科学院知识创新计划项目 |
韩兆雪 吴芳 赵桃 杨凡 钱刚 余懋群 |
韩兆雪(中国科学院成都生物研究所,四川成都,610041;中国科学院研究生院,北京,100039) ;吴芳(中国科学院成都生物研究所,四川成都,610041;中国科学院研究生院,北京,100039) ;赵桃(中国科学院成都生物研究所,四川成都,610041;中国科学院研究生院,北京,100039) ;杨凡(中国科学院成都生物研究所,四川成都,610041;中国科学院研究生院,北京,100039) ;钱刚(中国科学院成都生物研究所,四川成都,610041;中国科学院研究生院,北京,100039) ;余懋群(中国科学院成都生物研究所,四川成都,610041)
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中文摘要: |
为了阐明青稞种子中B组醇溶蛋白合成的遗传调控机制,为分子改良大麦和小麦籽粒品质奠定基础,以青稞品种Z09和Z26的基因组DNA为模板,根据已克隆的青稞B组醇溶蛋白(B-hordein)基因的5'端序列设计三个基因特异的反向引物,分别与随机简并引物配对,进行热不对称嵌套PCR(Thermal asymmetric interlaced PCR,TAIL-PCR)扩增,从两份西藏青稞材料中分离克隆出2个B-hordein基因的上游调控序列.序列测定结果表明,两个扩增片段长度分别为395和396 bp,加上已知B-hordein基因中的GSP2引物序列与翻译起始密码子之间198 bp的长度,则可得到约600 bp的B-hordein基因5'上游调控序列.将所得序列与Genbank中的三个贮藏蛋白基因的对应区段进行序列比对,所得序列与来自野生智利大麦(H.chilense)的B3-hordein基因(Genbank登录号:AY998010)、普通小麦(T.aestivum)的低分子量麦谷蛋白亚基基因(Genbank登录号:X07747)和栽培大麦(H.vulgare)的B-hordein基因(Genbank登录号:X03103)具有81%~95%的序列相似性.推测其TATA box位于-80 bp,CAAT-like box位于-140 bp处.另外,在-300 bp处存在一个胚乳盒(Endosperm Box,EB),包含EM基序和GCN4基序.EM基序高度保守,GCN4基序有一个核苷酸位点的突变.此外,在约-560 bp处存在一个胚乳盒类似结构. |
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