| 韩兆雪,吴芳,$2,$2,$2,余懋群.青稞B组醇溶蛋白基因5′上游调控区的TAIL-PCR克隆及序列分析[J].麦类作物学报,2007,27(4):613 |
| 青稞B组醇溶蛋白基因5′上游调控区的TAIL-PCR克隆及序列分析 |
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| 修订日期：2007-05-10 |
| DOI：10.7606/j.issn.1009-1041.2007.04.147 |
| 中文关键词: 青稞 B-hordein基因 上游调控序列 TAIL-PCR 序列分析 |
| 英文关键词:Highland barley(H. vulgare ssp. vulgare),Upstream regulation region,TAIL-PCR,B-hordein gene,Sequence analysis |
| 基金项目:科技部基础性工作专项（2006FY110700）资助项目;国家科技支撑计划农作物种质资源项目;中国科学院知识创新计划项目（KSCX2-SW-304）. |
| 韩兆雪 吴芳 $2 $2 $2 余懋群 |
| [1]中国科学院成都生物研究所,四川成都610041 [2]中国科学院研究生院,北京100039 |
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| 中文摘要: |
| 为了阐明青稞种子中B组醇溶蛋白合成的遗传调控机制，为分子改良大麦和小麦籽粒品质奠定基础，以青稞品种Z09和Z26的基因组DNA为模板，根据已克隆的青稞B组醇溶蛋白（B-hordein）基因的5’端序列设计三个基因特异的反向引物，分别与随机简并引物配对，进行热不对称嵌套PCR（Thermal asymmetric interlaeed PCR，TAIL-PCR）扩增，从两份西藏青稞材料中分离克隆出2个B-hordein基因的上游调控序列。序列测定结果表明，两个扩增片段长度分别为395和396bp，加上已知B-hordein基因中的GSP2引物序列与翻译起始密码子之间198bp的长度，则可得到约600bp的B-hordein基因5’上游调控序列。将所得序列与Genbank中的三个贮藏蛋白基因的对应区段进行序列比对，所得序列与来自野生智利大麦（H．chil-ense）的B3-hordein基因（Genbank登录号：AY998010）、普通小麦（T.aestivum）的低分子量麦谷蛋白亚基基因（Genbank登录号：X07747）和栽培大麦（H．vulgare）的B-hordein基因（Genbank登录号：X03103）具有81％～95％的序列相似性。推测其TATAbox位于-80bp，CAAT-likebox位于-140bp处。另外，在-300bp处存在一个胚乳盒（EndospermBox，EB），包含EM基序和GCN4基序。EM基序高度保守，GCN4基序有一个核苷酸位点的突变。此外，在约-560bp处存在一个胚乳盒类似结构。 |
| 英文摘要: |
| The specific primers were designed according to the published sequences of barley B-hordein genes from highland barley Z09 and Z26.Using total DNA isolated from them as the templates,two DNA fragments of about 400 bp upstream of the known B-hordein genes |
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