| 庞晓斌,毛新国,景蕊莲,昌小平,李彦舫.小麦EST数据批量分析平台的构建与应用[J].麦类作物学报,2006,26(3):146 |
| 小麦EST数据批量分析平台的构建与应用 |
| Construction and Application of Wheat EST Sequences Analysis Platform |
| 修订日期：2006-03-23 |
| DOI：10.7606/j.issn.1009-1041.2006.03.125 |
| 中文关键词: 小麦 EST数据 批量分析 生物信息学 水分胁迫 |
| 英文关键词:cDNA |
| 基金项目:国家转基因植物研究和产业化专项基金 |
| 庞晓斌 毛新国 景蕊莲 昌小平 李彦舫 |
| [1]吉林大学植物科学学院,吉林长春130062 [2]中国农业科学院作物科学研究所、农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程、农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,北京100081 |
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| 中文摘要: |
| 为进行EST数据批量分析，构建了EST／cDNA序列数据高通量、自动化分析平台。该平台基于Linux操作系统，主要由一些免费软件和perl程序构成．具有自动组装EST序列、查找同源基因、注释基因功能，同时具有进行基因分类等功能。利用该平台对小麦水分胁迫诱导表达的5个cDNA文库的6733条EST序列进行全面分析，初步建立了小麦水分胁迫诱导的基因表达谱。检测结果表明。小麦EST数据批量分析平台为批量EST序列的生物信息学分析提供了实用、便捷工具。 |
| 英文摘要: |
| A high throughput platform for EST/cDNA sequence data analysis was constructed based on Linux operation system, which included a few free software and perl script. A series of analysis could be automatically done on the platform, such as sequence assemble |
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